La Mesa nace como una iniciativa articulada de la Coordinación Zonal 1 del MSP, la Unión Europea, la cooperación alemana, Naciones Unidas y otros cooperantes, para optimizar la coordinación del trabajo en salud. En marzo 2020, como respuesta a la pandemia, empieza un trabajo articulado que continúa hoy. Las organizaciones habían trabajado con el MSP de forma bilateral, y la Mesa les permite trabajar en un grupo integrado. Las reuniones son semanales y virtuales, todos los martes a las 9 am.